Generar, transferir y comunicar conocimiento científico sobre taxonomía, sistemática, filogenia, ecología, genética, evolución, diversidad y conservación de la flora y fauna, así como interacciones bióticas y restauración de ecosistemas del Centro-Occidente de México y regiones adyacentes, y el resto del país. Formar recursos humanos de alto nivel y ofrecer servicios profesionales altamente especializados en este ámbito.

• Estudios florísticos de la zona del Bajío, Sierra y Costa de Michoacán
• Taxonomía, sistemática, filogenia, biogeografía y conservación de diversos grupos de Angiospermas
• Genética del paisaje, genómica ecológica y genética de la conservación
• Cambio climático global y su efecto en la extinción de la diversidad de reptiles
• Inter-dependencia entre interacciones biológicas y cambios ambientales en escala de paisaje y región
• Evaluación de interacciones biológicas que sustentan las redes de polinización y dispersión de semillas
• Restauración ecológica que favorezca la permanencia de interacciones bióticas y sus servicios ecosistémicos asociados en paisajes antropizados.
• Estudio y monitoreo de especies vegetales introducidas y malezoides que representen un peligro en la biodiversidad de la región.

Ser una red de investigación de referencia regional, nacional e internacional en el estudio y conservación de la flora y fauna de México y su nexo con el cambio climático global. Desarrollar y mantener una interacción dinámica y continua con instituciones y profesionales de otras disciplinas de investigación para desarrollar estudios y proyectos de interés global principalmente en el Centro-Occidente de México, así como el resto del país.