Generar, transferir y comunicar conocimiento científico sobre taxonomía, sistemática, filogenia, ecología, genética, evolución, diversidad y conservación de la flora y fauna, así como interacciones bióticas, microbiología ambiental y restauración de ecosistemas en México, con enfoque en el centro-occidente del país. Además, contribuir con soluciones innovadoras a problemas ambientales, agrícolas y forestales y fortalecer el vínculo de la ciencia con la sociedad a través del estudio de socioecosistemas sobre sociedades y territorios bioculturales. Formar recursos humanos de alto nivel y ofrecer servicios profesionales altamente especializados en este ámbito.

• Inventarios florísticos del centro-occidente de México
• Taxonomía, sistemática, filogenia, biogeografía y conservación de diversos grupos de Angiospermas
• Genética del paisaje, genómica ecológica y genética de la conservación
• Interacciones biológicas y cambios ambientales en escala de paisaje y región
• Restauración ecológica y servicios ecosistémicos
• Control biológico de plagas y enfermedades de cultivos michoacanos
• Ecología microbiana de suelos y plantas
• Estudio y monitoreo de especies vegetales introducidas invasivas
• Estudios socioambientales con énfasis en la sustentabilidad, memoria comunitaria y bioculturalidad, abordaje local y regional desde la mirada de la Investigación-Acción-Participativa

Ser una red de investigación de referencia regional, nacional e internacional en el estudio y conservación de la flora y fauna de México y su nexo con el cambio climático global. Desarrollar y mantener una interacción dinámica y continua con instituciones y profesionales de otras disciplinas de investigación para desarrollar estudios y proyectos de interés global principalmente en el Centro-Occidente de México, así como el resto del país.